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时间:2024-02-15 06:06    点击次数:193
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卵白由些许氨基酸脱水缩合陈列组成,含有一个游离的氨基(N端)和一个游离的羧基(C端)。C端与N打量似,在卵白质分子结构分析中具有垂死的地位,是卵白质齐备一级结构的必须信息,对C端序列进行测定具有垂死的敬爱。

北京百泰派克生物科技有限公司基于CNAS/ISO9001双重质料认证体系,凭证肽图分析(质谱法)旨趣,设置了针关于不同类别生物成品的卵白C端序列分析奇迹,可竣事对卵白、抗体、疫苗、多肽、重组胶原卵白等生物成品C端序列的测定。

工夫旨趣

现在尚未开导出访佛于Edman降解的C端序列测定工夫,因此卵白C端序列竟然证奇迹仍然所以质谱平台为基础。凭证靶卵白表面序列信息选拔互补性好的两种卵白酶酶切卵白,产生两个长度不同可是合乎离子化的C端肽段,经质谱检测,互相考据,最终笃定卵白C端序列。

附常见卵白酶酶切条目及位点:

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实践仪器

• 纳升级高效液相色谱仪:Easy-nLC 1200;

• 组合型四极杆-Orbitrap质谱仪:Q Exactive™ Hybrid Quadrupole-Orbitrap™ Mass Spectrometer。

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案例暗示

张军在发言中说,过去几天,安理会成员就巴以局势保持密切沟通。俄罗斯提出了决议草案,体现了聚焦人道关切、保护平民的大方向,得到了许多国家,包括埃及、沙特、约旦、卡塔尔等阿拉伯国家的共提。中方支持安理会发挥负责任作用,支持一切旨在推动冲突降级、恢复和平的努力,欢迎任何有利于保护平民、缓解人道危机的倡议。基于这一立场,中方对付诸表决的决议草案投了赞成票。

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样品卵白过程恰当的卵白酶酶切之后变成长度大多在6-28aa的肽段,参加质谱分析后产生的总离子流谱图如下:

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样品总离子流谱图(TIC)

(横坐标为时候(min),纵坐标为相对信号强度)

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通过一级质谱图不错赢得齐备肽段的分子量,mass=(m/z-1)*z

C端肽段一级质谱图

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(横坐标为检测到的m/z值,纵坐标为相对信号强度)

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二级质谱图赢得的是肽段的碎屑离子m/z值,齐备肽段在质谱中从肽键位置被打碎为碎屑离子,围聚肽段的N端的为b离子,围聚C端的为y离子(举例二级图中的肽段KTSTSPLVKSF, 二级碎裂之后,碎屑离子K和TSTSPLVKSF离别为b1和y10离子,碎屑离子KT和STSPLVKSF离别为b2和y9离子)。表面的碎屑离子m/z与本体二级图中的检测值匹配到的越多,竟然度越高。通过肽段二级碎裂片断信息笃定C端肽段序列

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肽段二级质谱图

(横坐标为检测到的m/z值,纵坐标为相对信号强度)

本体神志中会至少使用两种互补的卵白酶对靶卵白进行酶切,不错赢得两条长度不同的C端肽段,通过关于两条C端肽段序列的互相考据,最终笃定卵白的C端序列信息。

常见典型问题

问题1:卵白过程酶切后会在固定的位点断开,如何笃定C端的肽段便是卵白C端呢?

恢复:数据分析的时候会挑选N端为酶切位点而C端不是酶切位点的肽段,保证肽段是酶切形成的而不是立时的杂质肽段,同期保证肽段结尾与对比结尾是和谐的。

问题2:若是分析效果只须C结尾为酶切位点的肽段,如何跨越说明C端具体位置?

恢复:这种效果时时是两种情况变成的。第一种情况是卵白的C法例好是酶切位点,咱们不错通过不同酶切同期分析排斥这种情况。第二种是卵白C端离该酶切位点很近或很远,酶切之后剩余片断太短或太长,碎裂情况太差,无法被分析软件识别到宝马会体育,咱们不错设置一个梯度数据库,每个序列比上一下序列多一个氨基酸,欺诈梯度数据库再行比对分析。



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